মার্কিন উপকূলীয় বাস্তুতন্ত্রে দূষণের প্রাথমিক উৎস হল শিল্পের জলপ্রবাহ, তেল ছড়িয়ে পড়া, এবং প্লাস্টিক বর্জ্য।

শিল্পের জলপ্রবাহে রাসায়নিক এবং বিষাক্ত পদার্থ থাকে, যা উপকূলীয় পরিবেশকে দূষিত করে। তেল ছড়িয়ে পড়া, বিশেষ করে সমুদ্রতলায় বা উপকূলে, প্রবাল প্রাচীর এবং সামুদ্রিক জীববৈচিত্র্যের জন্য মারাত্মক ক্ষতি করতে পারে। প্লাস্টিক বর্জ্য, যা সাগরে চলে যায়, সামুদ্রিক প্রাণী এবং পরিবেশের জন্য বিপজ্জনক হতে পারে। এই সব ধরনের দূষণ মার্কিন উপকূলীয় বাস্তুতন্ত্রের জন্য গুরুতর হুমকি সৃষ্টি করে।