গ্রেট বেসিনের নদী এবং হ্রদগুলি মূলত লবণাক্ত পানি ধারণ করে, কারণ এই অঞ্চলের অনেক জলাশয়ে তাজা পানি প্রবাহিত হয় না এবং পানি শুকিয়ে লবণ জমা হয়।

গ্রেট বেসিনের অধিকাংশ নদী ও হ্রদ লবণাক্ত জল ধারণ করে। কারণ, এটি একটি এন্ডোরহেইক বেসিন, যেখানে নদী বা হ্রদের পানি কোনো মহাসাগরে পৌঁছায় না। পানি শুকিয়ে গেলে লবণ এবং খনিজগুলো জমা হয়, যা হ্রদ এবং নদীগুলিকে লবণাক্ত করে তোলে। উদাহরণস্বরূপ, গ্রেট সল্ট লেক একটি প্রধান লবণাক্ত হ্রদ এই অঞ্চলে অবস্থিত।